La estereoquímica es la parte de la química que estudia la distribución espacial de los átomos que componen las moléculas con el fin de conocer la influencia de estos sobre sus propiedades químicas y físicas, así como su reactividad. Proporciona conocimientos para la química en general, ya sea inorgánica, orgánica, biología, fisicoquímica o química de polímeros.

Uno de los casos médicos en los que la estereoquímica jugó una mala pasada es el conocido “desastre de la Talidomida”. En el año 1953 una compañía farmacéutica, Ciba, desarrolló este fármaco sin pensar en los resultados que podría tener. Fue comercializado como sedante y calmante para las náuseas producidas durante los primeros meses de embarazo. Se realizaron estudios en diversos animales de laboratorio para comprobar los efectos secundarios, pero no se encontró ninguno. Más…

Varios cientos de estudiantes toman la decisión de estudiar química a nivel universitario cada año. La mayoría de estos entran en este mundo con un vacío enorme a nivel orgánico que puede ser suplido por el uso de grandes herramientas de tratamiento de información química, como es ChemDraw. Los estudios previos a los universitarios podrían verse enormemente reforzados con esta interfaz, facilitando de esta forma el posterior entendimiento de la química universitaria. A continuación, se tratarán los aspectos básicos que pueden enseñarse en estudios previos universitarios.

Estructura molecular, conformación y configuración estructural

Uno de los primeros pasos en el entendimiento de la formulación química reside en saber distinguir conformación de configuración estructural, siendo necesario en el primer caso distintas orientaciones de los…

En esta noticia realizaremos una simulación sobre como dibujar proyecciones de Newman en ChemDraw, utilizaremos etano como ejemplo. Los puntos a seguir serán:

  • Dibujar una molécula de metano
  • Duplicaremos la estructura del metano y estableceremos una unión entre ambos
  • Utilizaremos la herramienta “orbital” para dibujar el círculo de la proyección de Newman
  • Rotaremos uno de los metanos sobre sí mismo 180˚
  • Analizaremos por completo la proyección de Newman

Dibujo de una molécula de metano

Para dibujar una molécula de etano en proyección de Newman será preciso dibujar un metano en el frente y otro en el fondo, respectivamente. Para ello es tan sencillo como usar el comando “enlace sólido” para introducir el primer enlace simple y, a partir de ahí, dibujar la siguiente estructura:

Pasos para dibujar la estructura de un metano (mitad del etano)
Pasos para dibujar la estructura de un metano (mitad del…

La combinación de las funcionalidades de ChemDraw y ChemFinder permite crear bibliotecas combinatorias con predicción de propiedades. En esta noticia se abordarán las siguientes funciones:

  • Expansión de estructuras genéricas en ChemDraw
  • Exportación de una lista de estructuras expandidas a un SDFile
  • Importación de SDFile en ChemFinder, uso como base de datos química
  • Predicción de propiedades y asignación de nombres para cada estructura mediante ChemFinder
  • Importación de SDFile en ChemDraw Excel
  • Creación de estructuras genéricas
  • Predecir propiedades y asignar nombres mediante ChemDraw Excel

Expansión de estructuras genéricas en ChemDraw

Comenzamos con una estructura genérica simple dibujada en ChemDraw, la cual expandimos para ver sus doce combinaciones.

Estructura genérica sin expandir
Estructura genérica sin expandir

Nuestro objetivo será crear una base de datos…

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