Desde ahora SysQuake está basado en la versión 3 del motor matemático y lenguaje de programación científica LME, que tiene un gran grado de compatibilidad con Matlab(TM).

Las mejoras están relacionadas principalmente con la programación orientada a objetos, la manipulación y recuperación de errores, el acceso a estructuras complejas y la resolución de problemas de programación lineal.

El número de nuevas características o mejoras de esta versión es superior a 90.

Con SysQuake se proporcionan nuevas extensiones: compresión de datos, soporte de ficheros de imagen PNG y JPEG, acceso directo a contenido de ficheros utilizando la misma sintaxis que los elementos de una matriz (en Mac OS X(TM)) y soporte de joystick (en Windows(TM)).