almaZen AnaLogic© contiene el módulo de análisis de datos (AnaLogic) del producto almaZen System©, la solución bioinformática al problema que supone la gestión de los miles de clones que se utilizan en la fabricación de un microarray. almaZen AnaLogic© permite el análisis de experimentos comparativos con microarrays y el seguimiento de todo el proceso desde el microarray hasta las placas multipocillo originales.

  • Importa los datos de cuantificación desde prácticamente cualquier programa de análisis de imagen gracias a la herramienta AnaLogic para definir formatos de cuantificación.
  • Almacena las imágenes de los microarrays (formatos TIFF o JPG) en la base de datos de AnaLogic.
  • Extrae los genes relevantes de experimentos replicados mediante la combinación de criterios estadísticos con umbrales biológicos clásicos. Además, permite búsquedas por palabras clave.

almaZen AnaLogic© incluye diversos métodos de normalización, dispone de cuatro tipos de representaciones de dispersión de puntos y permite dos formas distintas de seleccionar genes.

almaZen Plates2Arrays© contiene los módulos de gestión de placas y de gestión de arrays (PlateLogic y ArrayLogic, respectivamente) del producto almaZen System©, la solución bioinformática al problema que supone la gestión de los miles de clones que se utilizan en la fabricación de un microarray.

El módulo PlateLogic importa los ficheros de texto de las placas permitiendo manipularlas como lo haría un robot manejador de líquidos, o simulando un pipeteo virtual. Almacena los protocolos utilizados en el proceso y simula todas las transformaciones realizadas, almacenando toda la información generada durante el proceso y permitiendo la conexión a bases de datos externas. Una de las ventajas del módulo es que reduce la dependencia de otras personas como bioinformáticos.

El módulo ArrayLogic gestiona el proceso de seguimiento del clon, simula la creación del array, importa ficheros de los robots más habituales en el mercado (MicroGrid, GMS 417...), crea arrays a través de ficheros como GenePix y Quantarray, pudiendo exportarlos de igual modo a otros sistemas. Nuevamente, reduce la dependencia de bioinformáticos. Gracias a este módulo, identificar cada spot del array y revisar todas las manipulaciones previas (historial del spot) resulta sencillo e intuitivo.

almaZen PlateLogic© contiene el módulo de gestión de placas (PlateLogic) del producto almaZen System©, la solución bioinformática al problema que supone la gestión de los miles de clones que se utilizan en la fabricación de un microarray. almaZen PlateLogic© almacena toda la información relacionada con las placas multipocillo y sus clones en una base de datos de acceso rápido y sencillo.

  • Está orientado al trabajo con placas multipocillo e incluye múltiples herramientas para almacenar, manipular y anotar información relevante.
  • Permite, de una forma sencilla y flexible, almacenar cualquier tipo de información sobre un clon.
  • Identifica cada pocillo de la placa y revisa todas las manipulaciones desde su entrada en el laboratorio de una forma fácil e intuitiva.

Una serie de artículos sobre Redes de Aprendizaje y herramientas de cálculo han aparecido durante el 2004 en los números 65, 66, 67, 68 y 69 de la publicación Mundo Linux.

Entre las herramientas utilizadas para llevar a cabo el proyecto descrito en los artículos mencionados cabe destacar webMathematica. Es más, los artículos 65, 66 y 67 pueden servir de guía a las personas interesadas en montar redes de aprendizaje utilizando webMathematica (dadas las escasas referencias técnicas que existen sobre webMathematica en castellano). Entre otros temas se explica cómo montar un servidor basado en webMathematica, contenedor de servelets, Apache y servidor de Xfonts:

Biokmod es una caja de herramientas para resolver sistemas de ecuaciones diferenciales, ajuste de ecuaciones, convoluciones... aplicado a al modelado de sistemas biocinéticos lineales y no lineales con aplicaciones en farmacología, dosimetría interna y medicina nuclear entre otros campos.

Los modelos presentes en Biokmod han sido desarrollados con Mathematica y son ofrecidos a través del navegador web gracias a webMathematica. Para ello se ha contado con la colaboración de MolyPharma S.A. en el área de Medicina Nuclear y ENUSA Industrias Avanzadas en el área de la Energía Nuclear.

Remcom Inc. acaba de anunciar la disponibilidad de la versión 6.1 del software de simulación electromagnética XFDTD, que utiliza el método de las diferencias finitas en el dominio del tiempo.

La nueva versión del software incorpora grandes mejoras, entre las que destacamos:

  • Mallado adaptativo: refinamiento gradual de la malla para proporcionar más detalle únicamente donde es necesario.
  • Selección de caras y objetos basada en vistas
  • Barrido avanzado: las caras se pueden extrudir, revolver, o barrer a lo largo de caminos complejos.
  • Generación de capas: los objetos se pueden descascarillar generando capas del grosor deseado.
  • Edición con el ratón: Las herramientas de edición e interacción visual han sido mejoradas. Ahora los objetos se pueden seleccionar, escalar, rotar y mover con gran facilidad con el ratón en lugar del uso de comandos a través de cuadros de diálogo
  • Función deshacer/rehacer (undo/redo) mejorada
  • Mejoras importantes en el análisis SAR, incluyendo una sustancial mejora de la velocidad (el doble de la versión anterior), gran ahorro de la memoria y conformidad con los estándares SAR.
  • Materiales dieléctricos no lineales
  • Objeto antena bocina

En un entorno industrial altamente dinámico y competitivo, los tiempos de desarrollo y lanzamiento de nuevos productos deben ser minimizados, y los productos dotados de ventajas y peculiaridades que los hagan diferenciarse en el mercado; la innovación es una actitud imprescindible para la supervivencia de las industrias. Las herramientas de cálculo numérico e ingeniería asistida permiten desarrollar al máximo el potencial innovador de las industrias que las emplean.

El prototipado virtual permite enfrentarse a un nuevo diseño de manera virtual, pudiendo no sólo visualizar la pieza, sino también estudiar su comportamiento en condiciones reales, detectar y corregir fallos, ajustar el diseño, optimizar el proceso de fabricación, modelar el proceso de homologación y reproducir el ciclo de vida completo sin fabricar ni una sola pieza prototipo, con el consiguiente ahorro de tiempo, dinero y material.

Con el objetivo de difundir las estrategias que llevan al máximo aprovechamiento del prototipado virtual y la simulación de procesos, y sus ventajas en la praxis industrial, AIMEN organiza el próximo 24 de junio una jornada de simulación bajo el título "Jornada Técnica: La Simulación Numérica en la Industria".