Wolfram Research ofrece actualizaciones gratuitas de las librerías de funciones denominadas Application Packages a los usuarios registrados de éstas y que dispongan de Mathematica 4. Actualmente existen actualizaciones para las siguientes librerías:

• Calculus WIZ (para Windows, Macintosh).
• Control System Professional (para Windows, Macintosh, Unix).
• Digital Image Processing (para Windows, Macintosh, Unix).
• Dynamic Visualizer (para Windows, Macintosh).
• Electrical Engineering Examples (para Windows, Macintosh, Unix).
• Experimental Data Analyst (para Windows, Macintosh, Unix).
• Finance Essentials (para Windows, Macintosh, Unix).
• Mathematica Link para Excel (para Windows, Macintosh).
• Mechanical Systems (para Windows, Macintosh, Unix).
• Optica (para Windows, Macintosh, Unix).
• Scientific Astronomer (para Windows, Macintosh, Unix).
• Signals and Systems (para Windows, Macintosh, Unix).
• Time Series (para Windows, Macintosh, Unix).
• Wavelet Explorer (para Windows, Macintosh, Unix).

Estas actualizaciones deben ser descargadas a través de la página web de Wolfram Research.