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Los plasmas de baja temperatura representan una amalgama de mecánica de fluidos, ingeniería de reacciones, cinética física, transferencia de calor, transferencia de masa y electromagnetismo. Plasma Module es una herramienta especializada para el modelado de descargas de no equilibrio que ocurren en un amplio rango de disciplinas de ingeniería. Existen interfaces de modelado especializadas para la mayoría de los tipos de reactores de plasma más comunes incluyendo Plasmas Inductivamente Acoplados (ICP), Descargas de CC, Descargas calentadas por ondas (plasmas de microondas) y plasmas acoplados capacitivamente (CCP).

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CFD module se ha diseñado para la simulación avanzada de flujo. Sus interfaces listas para ser usadas permiten modelar flujos laminates y turbulentos en fases simples o múltiples. También incluye funcionalidades para tratar acoplamientos de flujo de medios porosos y libres, vasos agitados, e interacción fluido-estructura.

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COMSOL Chemical Reaction Engineering Module es un módulo diseñado para estudiar sistemas reactivos que incluyan efectos de tranporte de materiales y energía. Arrancando con modelos independientes del espacio, el módulo tiene herramientas para investigar la cinética utilizando diferentes químicas, bajo las típicas condiciones controladas para la escala de laboratorio y de banco. Para simular condiciones de operación realistas, el módulo utiliza estas químicas y entonces incluye los efectos de variaciones espaciales y de temperatura.

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El módulo Batteries and Fuel Cells Module es una herramienta especializada diseñada para modelar todo tipo de baterías y aplicaciones de células de combustible. El módulo ofrece interfaces perfectamente integradas y ajustadas para estudiar densidades de corriente primaria, secundaria, y terciaria en células electroquímicas. La célula puede contener electrodos sólidos o porosos y la disolución o electrolitos concentrados. Adicionalmente se pueden añadir acoplamientos multifísicos coo transferencia de calor, flujo de fluidos y reacciones electroquímicas a través de las capacidades multifísicas de COMSOL.